- Oggetto:
- Oggetto:
Biostat (DM 270) - a.a. 2012/13
- Oggetto:
Anno accademico 2012/2013
- Codice dell'attività didattica
- MFN0340
- Docenti
- Prof. Maria Teresa Giraudo (Titolare del corso)
Prof. Michele De Bortoli (Titolare del corso) - Corso di studi
- Laurea in Matematica
- Anno
- 3° anno
- Periodo didattico
- Primo semestre
- Tipologia
- D.M. 270 - TAF C
- Crediti/Valenza
- 6
- SSD dell'attività didattica
- BIO/11 - biologia molecolare
MAT/06 - probabilita' e statistica matematica - Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Scritto
- Mutuato da
- SSD: 3 cfu BIO/11, 3 cfu MAT/06
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso si prefigge di fornire agli studenti gli strumenti per eseguire semplici analisi statistiche tramite un software specifico e di far comprendere agli studenti l’utilità delle applicazioni pratiche della Statistica prendendo spunto dal suo utilizzo nel contesto della biologia. L’utilizzo di dati biologici permetterà di mostrare le difficoltà legate all'elaborazione statistica in situazioni reali anche di natura complessa. Si forniscono quindi nel contempo agli studenti alcune nozioni basilari relative a misurazioni biologiche, desunte dalla ricerca anche più recente.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Lo studente dovrà essere in grado di effettuare l’analisi statistica di dati provenienti sia da simulazioni che da misure sperimentali utilizzando un opportuno software statistico. Avrà acquisito la capacità di utilizzare gli strumenti dell’analisi statistica di base per progettare semplici esperimenti e trarre informazioni rilevanti dai set di dati disponibili.
- Oggetto:
Programma
1 CFU (MAT/06) Analisi di dati simulati: regressione, ANOVA a una o più vie, bontà di un fit, test di ipotesi sui parametri.
3 CFU (BIO/1-19*)
Misure osservazionali: Analisi cliniche; specificità, sensibilità, efficienza del test, ROC curves. Studi clinici: associazioni, relazioni, test di significatività.
Introduzione all'epidemiologia.
Misure osservazionali nelle scienze naturali.
Misure sperimentali: Esperimenti singoli; cause principali di campionamento ridotto. Come affrontare la significatività in presenza di N molto basso.
Misure biochimiche e fitting delle ipotesi teoriche. Relazioni e coefficiente di correlazione. Propagazione della varianza in misure indirette. Valutazione del best fitting.
Misure multiple: genomica. Microarrays. Contenuto informazionale delle sequenze: il problema del gruppo di controllo.
2 CFU (MAT/06) Analisi di dati relativi a problemi biologici: risposta ai quesiti, suggerimento di eventuali ulteriori indagini e di interazione col biologo per interpretare i risultati statistici . Difficoltà legate alla taglia del campione. Necessità di tecniche non parametriche e specifiche.
1 CFU (MAT/06) Statistical Analysis of simulated data sets: linear regression, one way ANOVA, goodness of fit, parametric hypothesis testing.
3 CFU (BIO/1-19*)
Observational measures: Clinical analysis; specificity, sensitivity, test efficiency, ROC curves. Clinical studies: associations, relationships, significance tests.
Introduction to epidemiology.
Observational measures in the natural sciences.
Experimental measures: Single experiments; main causes of reduced sampling. How to get significance with very small N.
Biochimical measures and theoretical hypothesis fitting. Relationships and correlation coefficient. Variance propagation in indirect measures. Best fitting.
Multiple measures: genomics. Microarrays. Information content of sequences: the problem of control group.
2 CFU (MAT/06) Statistical analysis of data set from biological measures: answer to questions, suggestions for possible further investigation and for intercation with biologists. Problems arising from sample sizes. Necessity for non-parametric and ad-hoc techniques.
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
1) Materiale fornito dai docenti
2) P. Dalgaard Introductory Statistics with R, Springer 2008
3) G. Espa, R. Micciolo Problemi ed esperimenti di statistica con R, Apogeo 2008
- Oggetto:
Note
BIOSTAT, MFN0340 (DM 270) , 6 CFU: 3 CFU, MAT/06, TAF C (Affine), Ambito attività formative affini o integrative. 3 CFU, BIO/11, TAF C (Affine), Ambito attività formative affini o integrative.
Modalità di verifica/esame: Esame in aula informatizzata durante il quale verrà richiesto agli studenti di eseguire un’analisi statistica completa di un set di dati biologici, fornendo conclusioni e suggerimenti per l’interpretazione dei risultati biologici anche in vista di possibili ulteriori esperimenti, e di rispondere ad alcune domande relative agli argomenti di Biologia trattati.
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