- Oggetto:
- Oggetto:
Biostat (DM 270) - a.a. 2013/14
- Oggetto:
Biostat
- Oggetto:
Anno accademico 2013/2014
- Codice dell'attività didattica
- MFN0340
- Docente
- Prof. Maria Teresa Giraudo (Titolare del corso)
- Corso di studi
- Laurea in Matematica
- Anno
- 3° anno
- Periodo didattico
- Primo semestre
- Tipologia
- D.M. 270 TAF C - Affine o integrativo
- Crediti/Valenza
- 6
- SSD dell'attività didattica
- BIO/11 - biologia molecolare
MAT/06 - probabilita' e statistica matematica - Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Scritto
- Prerequisiti
- Preferibilmente avere superato l'esame di Calcolo delle Probabilità e Statistica
- Mutuato da
- SSD: 3 cfu BIO/11, 3 cfu MAT/06
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso si prefigge di far comprendere agli studenti l’utilità delle applicazioni pratiche della Statistica prendendo spunto dal suo utilizzo nel contesto della biologia cellulare. L’utilizzo di dati biologici permetterà di mostrare le difficoltà legate alla elaborazione statistica in situazioni reali di natura complessa. Si forniscono quindi nel contempo agli studenti alcune nozioni basilari relative alla morfologia e alla funzionalità cellulare, desunte dalla ricerca anche più recente.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Lo studente dovrà essere in grado di effettuare un’analisi statistica approfondita di dati provenienti sia da simulazioni che da misure cellulari sperimentali utilizzando anche un opportuno software statistico. Avrà acquisito la capacità di utilizzare gli strumenti dell’analisi statistica di base per progettare semplici esperimenti e trarre informazioni rilevanti dai set di dati disponibili.
- Oggetto:
Programma
1 CFU (MAT/06) Analisi di dati simulati: regressione, ANOVA a una o più vie, bontà di un fit, test di ipotesi sui parametri
3 CFU (BIO/1-19*)
o Dalla biologia descrittiva alla biologia quantitativa: descrizione della cellula e misure di interesse biologico sulle cellule. Quantità di interesse biologico: cosa si misura e a cosa si vuole rispondere.
o Tipologie di risposte a livello cellulare: misurazione della proliferazione, della migrazione o del differenziamento (morfologia) cellulare. Tipologie di risposte a livello molecolare: regolazioni dell’espressione genica, misurazione dei livelli di espressione di mRNA attraverso PCR, misurazione dei livelli di espressione proteica. Descrizione delle metodologie e del loro utilizzo.
o Il disegno sperimentale in biologia. Controlli e punti sperimentali. Errore intracampione (errore tecnico) e variabilità intercampione.
2 CFU (MAT/06) Analisi di dati relativi a proliferazione cellulare, espressione genica, espressione proteica: risposta ai quesiti, suggerimento di eventuali ulteriori indagini. Difficoltà legate alla taglia del campione. Necessità di tecniche non parametriche, utilizzo dell’ANOVA per individuare eventuali nuove variabili coinvolte nell’esperimento. Interazione col biologo per interpretare i risultati statistici (interattivo con i docenti di Biologia).
1 CFU (MAT/06) Statistical Analysis of simulated data sets: linear regression, one way and two way ANOVA, goodness of fit, parametric hypothesis testing.
3 CFU (BIO/1-19*)
o From descriptive to quantitative Biology: cell description and biologically relevant measures on cells. Biologically significant quantities: what is to be measured and which questions are to be answered.
o Responses at the cell level: measure of proliferation, of migration and of differentiation (morphology) for cells. Responses at the molecular level: regulations of genic expression, measure of mRNA expression levels by means of PCR, measure of protein expression levels. Description of different techniques and of their use.
o Design of biological experiments. Controls and sample points. Within-sample error (technical error) and Across-sample variation.
2 CFU (MAT/06) Statistical analysis of data set from cell proliferation, genic expression, protein expression: answer to questions, suggestions for possible further investigation. Problems arising from sample sizes. Necessity for non-parametric techniques, use of ANOVA to detect possible new variables involved in the experiment. Interaction with the biologist to analyse the statistical results (interaction with Biology teachers).
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
1) Materiale fornito dai docenti 2) Manuale di Statistica 3) Middleton, “Analisi statistica con Excel”, Apogeo (2004)
- Oggetto:
Note
BIOSTAT, MFN0340 (DM 270) , 6 CFU: 3 CFU, MAT/06, TAF C (Affine), Ambito attività formative affini o integrative. 3 CFU, BIO/11, TAF C (Affine), Ambito attività formative affini o integrative.
Modalità di verifica/esame: Esame in aula informatizzata durante il quale verrà richiesto agli studenti di eseguire un’analisi statistica completa di un set di dati biologici, fornendo conclusioni e suggerimenti per l’interpretazione dei risultati biologici anche in vista di possibili ulteriori esperimenti.
- Oggetto:
